当研究科学家加里·隆戈第一次看到沙丁鱼基因组分析的结果时，他认为他一定是混淆了样本。

除了西海岸常见的太平洋沙丁鱼外，许多鱼似乎属于其他物种。“这真是太令人震惊了，”他说。然后他将它们的遗传密码与其他已知物种进行了比较。“那是我们意识到我们正在研究第二种沙丁鱼的&luo;顿悟时刻&ruo;。”

分析显示，在美国国家海洋和大气管理局渔业局 2021 年和 2022 年沿海远洋物种调查期间采集的 345 个沙丁鱼样本中，2021 年的所有鱼都是太平洋沙丁鱼，但 2022 年采集的鱼则是太平洋沙丁鱼和日本沙丁鱼的混合。

次年对另外 825 条沙丁鱼的检查也得出了同样的结果：许多都是日本沙丁鱼。日本沙丁鱼只产于北太平洋西侧亚洲附近，此前从未在西海岸发现过。

美国国家海洋和大气管理局渔业局和其他机构的科学家在《分子生态学》杂志上报道了这一意外发现。这两个物种看起来非常相似，只有通过基因检测才能区分它们。科学家们利用基因组测序的最新进展，检查了数百万个遗传标记的数据，并构建了沙丁鱼的完整线粒体基因组以验证身份。

2022 年和 2023 年，从华盛顿州到南加州都发现了日本沙丁鱼，它们有时会与太平洋沙丁鱼一起成群游动。日本沙丁鱼的年龄为 1 至 3 岁，是沙丁鱼的典型成年年龄组。